L’APEFE et WBI disposent d’un réseau étendu de représentations locales permettant d’assurer la qualité des activités exécutées et du dialogue politique avec les autorités pour l’APEFE. Reliés à Bruxelles par l’intermédiaire des administrateurs de programmes et chargés de missions, les « bureaux » assurent le suivi administratif et financier quotidien, relatif à la mise en œuvre des activités programmées.